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Paquet : theseus (3.3.0-14)

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superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance

Theseus est un programme qui superpose simultanément plusieurs structures macromoléculaires. Theseus trouve la solution optimale du problème de superposition en utilisant la méthode du maximum de vraisemblance. En abaissant le poids de zones variables de la superposition et en rectifiant pour des corrélations parmi les atomes, la méthode de superposition par maximum de vraisemblance produit des alignements de structures très justes.

Lorsque des macromolécules avec des séquences résiduelles différentes sont superposées, d’autres programmes et algorithmes remplacent ces résidus alignés par des trous. Theseus, cependant, utilise un nouvel algorithme de superposition qui inclut toutes les données.

Étiquettes: Biologie: Protéines, Domaine: Biologie, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, But: Analyse, use::comparing, works-with-format::plaintext

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