Package: mira-assembler (4.9.6-11) [debports]

[ Source:  ]

전체 게놈 샷건 및 EST 시퀀스 어셈블러

mira 게놈 조각 어셈블러는 많은 양의 유사한 반복으로 'hard'로 분류된 시퀀싱 프로젝트에 전문화된 어셈블러입니다. 명시적 시퀀스 태그 (ESTs) 전사물을 위 해, miraEST는 상이한 변이체에서 발생하는 단일 뉴클레오타이드 다형성 (SNP)을 검출하고 분류하는 동안 원래의 mRNA 전사물을 재구성하는데 특화되어 있습니다.

어셈블러는 상이한 세포 유형에서의 돌연변이 검출, 유기체 간의 전사물의 유사 성 분석, 임상 미세배열 실험에서 올리고 디자인을 위한 다양한 출처의 시퀀스 초기 어셈블리같은 다양한 작업에서 일상적으로 사용됩니다.

패키지는 다음 실행파일을 제공합니다: 제공되는 바이너리:

 * mira: 게놈 시퀀스의 어셈블리를 위해
 * miramem: 어셈블 프로젝트에 필요한 메모리 계산.
 * mirabait: 256 개의 베이스까지 kmers로 읽기를 선택하는 "grep"과 유사한 도구
 * miraconvert: 시퀀스 어셈블리 파일과 관련된 모든 종류의 데이타를 변환,
   추출, 때대로 재계산하는 도구.

Other Packages Related to mira-assembler

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++

• dep: libboost-thread1.83.0 (>= 1.83.0)

  portable C++ multi-threading

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  XML 파싱 C 라이브러리 - 런타임 라이브러리

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC 기능 지원 라이브러리

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) 지원 라이브러리

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 표준 C++ 라이브러리 v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

  압축 라이브러리 - 런타임

• rec: mira-rfam-12s-rrna

  extract of RFAM 12 rRNA database

• sug: mira-doc

  documentation for the mira assembler

Download mira-assembler

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64 (unofficial port)	2,395.3 kB	8,224.0 kB	[list of files]