[ Source: mira ]
Package: mira-assembler (4.9.6-7 and others)
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Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
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- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [sourceforge.net]
Similar packages:
전체 게놈 샷건 및 EST 시퀀스 어셈블러
mira 게놈 조각 어셈블러는 많은 양의 유사한 반복으로 'hard'로 분류된 시퀀싱 프로젝트에 전문화된 어셈블러입니다. 명시적 시퀀스 태그 (ESTs) 전사물을 위 해, miraEST는 상이한 변이체에서 발생하는 단일 뉴클레오타이드 다형성 (SNP)을 검출하고 분류하는 동안 원래의 mRNA 전사물을 재구성하는데 특화되어 있습니다.
어셈블러는 상이한 세포 유형에서의 돌연변이 검출, 유기체 간의 전사물의 유사 성 분석, 임상 미세배열 실험에서 올리고 디자인을 위한 다양한 출처의 시퀀스 초기 어셈블리같은 다양한 작업에서 일상적으로 사용됩니다.
패키지는 다음 실행파일을 제공합니다: 제공되는 바이너리:
* mira: 게놈 시퀀스의 어셈블리를 위해 * miramem: 어셈블 프로젝트에 필요한 메모리 계산. * mirabait: 256 개의 베이스까지 kmers로 읽기를 선택하는 "grep"과 유사한 도구 * miraconvert: 시퀀스 어셈블리 파일과 관련된 모든 종류의 데이타를 변환, 추출, 때대로 재계산하는 도구.
Other Packages Related to mira-assembler
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- dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)
- filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
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- dep: libboost-regex1.74.0-icu72
- virtual package provided by libboost-regex1.74.0
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- dep: libboost-thread1.74.0 (>= 1.74.0)
- portable C++ multi-threading
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU C 라이브러리: 공유 라이브러리
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libexpat1 (>= 2.0.1)
- XML 파싱 C 라이브러리 - 런타임 라이브러리
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 기능 지원 라이브러리
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) 지원 라이브러리
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU 표준 C++ 라이브러리 v3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 압축 라이브러리 - 런타임
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- rec: mira-rfam-12s-rrna
- extract of RFAM 12 rRNA database
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- sug: mira-doc
- documentation for the mira assembler
Download mira-assembler
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| s390x | 4.9.6-7+b1 | 1,928.3 kB | 7,272.0 kB | [list of files] |