ソースパッケージ: bioperl-run (1.7.2-4)
bioperl-run に関するリンク
Debian の資源:
メンテナ:
外部の資源:
その他の bioperl-run 関連パッケージ
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- adep:
debhelper
(>= 11~)
- helper programs for debian/rules
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- idep:
perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- idep:
libmodule-build-perl
- Perl モジュールのビルドおよびインストール用フレームワーク
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- idep:
bioperl
- Perl tools for computational molecular biology
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- idep:
libalgorithm-diff-perl
- module to find differences between files
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- idep:
libipc-run-perl
- Perl module for running processes
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- idep:
libio-string-perl
- IO::File インターフェースをインコア文字列でエミュレート
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- idep:
libxml-twig-perl
- 巨大な XML 文書を木構造モードで処理するための Perl モジュール
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- idep:
libtest-most-perl
- Perl module with the most commonly needed test functions and features
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- idep:
libarray-compare-perl
- Perl module to easily compare arrays
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- idep:
libtree-dagnode-perl
- Perl (super)class for representing nodes in a tree
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- idep:
amap-align
- Protein multiple alignment by sequence annealing
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- idep:
bedtools
- suite of utilities for comparing genomic features
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- idep:
blast2
- transitional dummy package to ncbi-blast+-legacy
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- idep:
bowtie
- Ultrafast memory-efficient short read aligner
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- idep:
bwa
- Burrows-Wheeler Aligner
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- idep:
clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
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- idep:
emboss
- ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート
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- idep:
exonerate
- generic tool for pairwise sequence comparison
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- idep:
hmmer
- タンパク質配列解析用のプロファイル隠れマルコフモデル
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- idep:
hyphy-mpi
- Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
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- idep:
infernal
- inference of RNA secondary structural alignments
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- idep:
kalign
- グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント
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- idep:
maq
- maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences
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- idep:
mafft
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
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- idep:
muscle
- タンパク質配列のマルチプルアライメントプログラム
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- idep:
ncoils
- coiled coil secondary structure prediction
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- idep:
phylip
- package of programs for inferring phylogenies
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- idep:
phyml
- Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood
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- idep:
primer3
- tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification
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- idep:
probcons
- 確率的で整合性に基づく多重配列アライメント
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- idep:
raxml
- Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
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- idep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
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- idep:
sim4
- cDNA とゲノム DNA の整列用ツール
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- idep:
t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
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- idep:
tigr-glimmer
- 古細菌やバクテリアから遺伝子を発見
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- idep:
wise
- DNA 配列とタンパク質配列のような生体高分子の比較
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- idep:
libwww-perl
- world-wide web へのシンプルで一貫性のあるインターフェース
