[ ソース: htseq ]
パッケージ: python3-htseq (2.0.5-2 など)
python3-htseq に関するリンク
Debian の資源:
htseq ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www-huber.embl.de]
類似のパッケージ:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
study the data quality.
* Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
a genome browser.
* Reading in annotation data from a GFF file.
* Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
genes.
その他の python3-htseq 関連パッケージ
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC 共有ライブラリ
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.12~)
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- 以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python3-numpy
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)