[ Source: htseq ]
Paketti: python3-htseq (2.0.9+dfsg-1)
Links for python3-htseq
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti htseq:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Diane Trout (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [www-huber.embl.de]
Samankaltaisia paketteja:
Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to study the data quality. * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in a genome browser. * Reading in annotation data from a GFF file. * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and genes.
Muut pakettiin python3-htseq liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.14)
- dep: python3 (>= 3.12~)
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
-
- dep: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Imuroi python3-htseq
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
ppc64el | 386.5 kt | 2,289.0 kt | [tiedostoluettelo] |