パッケージ: kalign (1:3.4.0-1) [debports]
グローバルおよびプログレッシブ多重配列アライメント
Kalign は、生物学的配列の多重アライメント実行用コマンドラインツールです。ア ライメントの正確さと速度の両方を改善するため、Muth-Manber の文字列照合アル ゴリズムを使用します。グローバルかつプログレッシブなアライメント手法を利用 しており、その上で、配列間距離の計算への近似文字列照合アルゴリズムの使用 と、ローカルのマッチを別のグローバルアライメントに組み込むことにより、機能 がさらに強化されています。
その他の kalign 関連パッケージ
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- enh: bioperl-run
- BioPerl wrappers: scripts
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment