Paket: kalign (1:3.4.0-1) [debports]
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- Homepage [msa.sbc.su.se]
Ähnliche Pakete:
Globales und fortschreitendes multiples Sequenzalignment
Das Befehlszeilenwerkzeug Kalign gleicht mehrere biologische Sequenzen ab. Für die Erhöhung von Präzision und Geschwindigkeit nutzt es den Muth-Manber-Algorithmus, der in großen Datenmengen sich wiederholende Muster ermittelt. Das Programm verwendet einen globalen, fortschreitenden Alignment-Ansatz, ergänzt durch den Einsatz eines annähernden Musterabgleich-Algorithmus zur Berechnung von Sequenzabständen und durch die Einbeziehung lokaler Übereinstimmungen in ein ansonsten globales Alignment.
Andere Pakete mit Bezug zu kalign
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
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- enh: bioperl-run
- BioPerl-Hüllen: Skripte
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- enh: t-coffee
- Multiple Sequence Alignment
kalign herunterladen
Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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ia64 (inoffizielle Portierung) | 105,1 kB | 557,0 kB | [Liste der Dateien] |