パッケージ: gatb-core (1.4.2+dfsg-13 など) [debports]
Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph
The GATB-CORE project provides a set of highly efficient algorithms to analyse NGS data sets. These methods enable the analysis of data sets of any size on multi-core desktop computers, including very huge amount of reads data coming from any kind of organisms such as bacteria, plants, animals and even complex samples (e.g. metagenomes). Read more about GATB at https://gatb.inria.fr/. By itself GATB-CORE is not an NGS data analysis tool. However, it can be used to create such tools. There already exist a set of ready-to-use tools relying on GATB-CORE library: see https://gatb.inria.fr/software/
その他の gatb-core 関連パッケージ
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- dep: libc6.1 (>= 2.37)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
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- dep: libcppunit-1.15-0 (>= 1.15.1)
- Unit Testing Library for C++
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C runtime files - serial version
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム