パッケージ: gatb-core (1.4.2+dfsg-13 など)

gatb-core に関するリンク

Debian の資源:

gatb-core ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph

The GATB-CORE project provides a set of highly efficient algorithms to analyse NGS data sets. These methods enable the analysis of data sets of any size on multi-core desktop computers, including very huge amount of reads data coming from any kind of organisms such as bacteria, plants, animals and even complex samples (e.g. metagenomes). Read more about GATB at https://gatb.inria.fr/. By itself GATB-CORE is not an NGS data analysis tool. However, it can be used to create such tools. There already exist a set of ready-to-use tools relying on GATB-CORE library: see https://gatb.inria.fr/software/

その他の gatb-core 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, hppa, ia64 以外]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libcppunit-1.15-0 (>= 1.15.1)

Unit Testing Library for C++
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [arm64, hppa, ia64, ppc64el 以外]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libhdf5-103-1 [hppa]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libhdf5-103-1t64 [hppa 以外]

HDF5 C runtime files - serial version
dep: libstdc++6 (>= 12) [hppa]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64]

dep: libstdc++6 (>= 14) [hppa, ia64 以外]
dep: libunwind8 [ia64]

プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

圧縮ライブラリ - ランタイム

gatb-core のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-13+b1	2,895.3 kB	22,928.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.4.2+dfsg-13+b2	3,229.7 kB	22,207.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.4.2+dfsg-13+b2	2,972.3 kB	21,960.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-10	2,484.0 kB	17,975.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-13+b1	3,643.7 kB	32,770.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.4.2+dfsg-13+b2	3,532.5 kB	32,747.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-13+b2	3,694.3 kB	29,256.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.4.2+dfsg-13+b2	3,150.5 kB	26,056.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.4.2+dfsg-13+b2	2,875.2 kB	18,236.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-13+b2	2,404.9 kB	22,634.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.4.2+dfsg-13+b2	2,864.9 kB	19,326.0 kB	[ファイル一覧]