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パッケージ: tree-ppuzzle (5.2-11)

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最尤法による系統樹の再構築 (並列化版)

TREE-PUZZLE (PUZZLE の新たな名前) は対話式のコンソールプログラムで、 巨大なデータセットを解析して、個々の内分枝の支持の推定を自動的に 割り当てる高速なツリー検索アルゴリズム quartet puzzling を実装しています。 TREE-PUZZLE はまた、ユーザが指定した系統樹に対して、その枝長だけで なく、ペアワイズ最尤距離も計算します。枝長は分子時計の仮定の下でも 計算することができます。さらに、TREE-PUZZLE は、仮定した内分枝の支持を ツリー全体を計算することなく調査し、配列アライメントの系統学的な 内容を視覚化する、尤度マッピングという新たな方法を提供します。

このパッケージは tree-puzzle の並列化バージョンです。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, use::comparing, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

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arm64 142.4 kB353.0 kB [ファイル一覧]
armhf 135.8 kB269.0 kB [ファイル一覧]
i386 150.4 kB381.0 kB [ファイル一覧]