[ ソース: htseq ]
パッケージ: python-htseq (0.11.2-1)
python-htseq に関するリンク
Debian の資源:
htseq ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www-huber.embl.de]
類似のパッケージ:
Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
study the data quality.
* Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
a genome browser.
* Reading in annotation data from a GFF file.
* Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
genes.
This package contains the Python 2 module.
python-htseq を提供するパッケージ
- python3-htseq
- Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
その他の python-htseq 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: python
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7)
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- dep: python-numpy
- Numerical Python - Python 言語に高速な配列操作機能を追加
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- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)