[ Quellcode: htseq ]
Paket: python-htseq (0.11.2-1)
Links für python-htseq
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket htseq herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [www-huber.embl.de]
Ähnliche Pakete:
Python high-throughput genome sequencing read analysis utilities
HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:
* Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
study the data quality.
* Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
a genome browser.
* Reading in annotation data from a GFF file.
* Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
genes.
This package contains the Python 2 module.
Pakete, die python-htseq bereitstellen
- python3-htseq
- Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities
Andere Pakete mit Bezug zu python-htseq
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC Support-Bibliothek
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- dep: libstdc++6 (>= 5)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
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- dep: python
- Interaktive objektorientierte Hochsprache (Python2-Version)
- dep: python (<< 2.8)
- dep: python (>= 2.7)
-
- dep: python-numpy
- Numerical Python fügt der Sprache Python eine schnelle Array-Einrichtung hinzu
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- dep: python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
python-htseq herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| arm64 | 187,5 kB | 760,0 kB | [Liste der Dateien] |