パッケージ: python-biopython (1.73+dfsg-1)

[ ソース: python-biopython  ]

Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)

The Biopython Project is an international association of developers of freely available Python tools for computational molecular biology.

It is a distributed collaborative effort to develop Python libraries and applications which address the needs of current and future work in bioinformatics. The source code is made available under the Biopython License, which is extremely liberal and compatible with almost every license in the world. The project works along with the Open Bioinformatics Foundation, who generously provide web and CVS space for the project.

This package is targeting Python version 2.

タグ: ソフトウェア開発: Python での開発, ライブラリ, 分野: field::biology, field::biology:bioinformatics, 実装言語: Python, 役割: role::devel-lib, role::shared-lib

その他の python-biopython 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: python

  対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (Python2 バージョン)

  dep: python (<< 2.8)

  dep: python (>= 2.7~)

• dep: python-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

  Numerical Python - Python 言語に高速な配列操作機能を追加

• dep: python-numpy-abi9

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: python-numpy

• dep: python-reportlab

  ReportLab library to create PDF documents using Python

• rec: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• rec: python-biopython-doc (= 1.73+dfsg-1)

  Documentation for the Biopython library

• sug: clustalo

  General purpose multiple sequence alignment program for proteins

• sug: clustalw

  global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

• sug: dialign

  Segment-based multiple sequence alignment

• sug: dssp

  protein secondary structure assignment based on 3D structure

• sug: emboss

  ヨーロッパ分子生物学オープンソフトウェアスイート

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

• sug: muscle

  タンパク質配列のマルチプルアライメントプログラム

• sug: phylip

  package of programs for inferring phylogenies

• sug: phyml

  Phylogenetic estimation using Maximum Likelihood

• sug: prank

  Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences

• sug: probcons

  確率的で整合性に基づく多重配列アライメント

• sug: python-matplotlib

  Python based plotting system in a style similar to Matlab

• sug: python-mysqldb

  Python interface to MySQL

• sug: python-pil

  Python 画像ライブラリ (Pillow フォーク)

• sug: python-psycopg2

  Python module for PostgreSQL

• sug: python-rdflib (>= 4)

  Python library containing an RDF triple store and RDF parsers/serializers

• sug: python-renderpm

  python low level render interface

• sug: python-scipy

  scientific tools for Python

• sug: python-tk

  Tkinter - Writing Tk applications with Python2

• sug: raxml

  Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

• sug: w3-dtd-mathml

  数式マークアップ言語 V2.0 DTD

• sug: wise (>= 2.4.1-16)

  DNA 配列とタンパク質配列のような生体高分子の比較

python-biopython のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
arm64	1,291.9 kB	8,907.0 kB	[ファイル一覧]