[ ソース: samtools ]
パッケージ: samtools (1.9-4)
samtools に関するリンク
Debian の資源:
samtools ソースパッケージをダウンロード:
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.htslib.org]
類似のパッケージ:
processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.
その他の samtools 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libhts2 (>= 1.9)
- C library for high-throughput sequencing data formats
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- dep: libncurses6 (>= 6)
- 端末処理用共有ライブラリ
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- dep: libtinfo6 (>= 6)
- 端末を扱う低レベルの terminfo 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム