[ bullseye ]
[ sid ]
[ ソース: pplacer ]
パッケージ: pplacer (1.1~alpha19-4)
phylogenetic placement and downstream analysis
Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.
Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.
その他の pplacer 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
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- dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)
- SQLite 3 共有ライブラリ
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム