Paketti: pplacer (1.1~alpha19-4)

[ Source: pplacer  ]

phylogenetic placement and downstream analysis

Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.

Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.

Muut pakettiin pplacer liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgsl25 (>= 2.6)

  GNU Scientific Library (GSL) -- library package

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)

  SQLite 3 (jaettu kirjasto)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi pplacer

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	2,864.1 kt	17,835.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3,421.1 kt	20,802.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3,022.8 kt	19,771.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2,681.2 kt	19,700.0 kt	[tiedostoluettelo]