Paketti: pplacer (1.1~alpha19-4)
Links for pplacer
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti pplacer:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Shayan Doust (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
phylogenetic placement and downstream analysis
Pplacer places reads on a phylogenetic tree. guppy (Grand Unified Phylogenetic Placement Yanalyzer) yanalyzes them. rppr is a helpful tool for working with reference packages.
Pplacer places query sequences on a fixed reference phylogenetic tree to maximize phylogenetic likelihood or posterior probability according to a reference alignment. Pplacer is designed to be fast, to give useful information about uncertainty, and to offer advanced visualization and downstream analysis.
Muut pakettiin pplacer liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgsl25 (>= 2.6)
- GNU Scientific Library (GSL) -- library package
-
- dep: libsqlite3-0 (>= 3.25.0)
- SQLite 3 (jaettu kirjasto)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
Imuroi pplacer
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
amd64 | 2,864.1 kt | 17,835.0 kt | [tiedostoluettelo] |
arm64 | 3,421.1 kt | 20,802.0 kt | [tiedostoluettelo] |
ppc64el | 3,022.8 kt | 19,771.0 kt | [tiedostoluettelo] |
s390x | 2,681.2 kt | 19,700.0 kt | [tiedostoluettelo] |