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パッケージ: tabix (1.11-4)

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generic indexer for TAB-delimited genome position files

Tabix indexes files where some columns indicate sequence coordinates: name (usually a chromosome), start and stop. The input data file must be position sorted and compressed by bgzip (provided in this package), which has a gzip like interface. After indexing, tabix is able to quickly retrieve data lines by chromosomal coordinates. Fast data retrieval also works over network if an URI is given as a file name.

This package is built from the HTSlib source, and provides the bgzip, htsfile, and tabix tools.

タグ: 実装言語: C, 役割: プログラム, 科学: science::calculation, use::calculating, サポート形式: HyperText Markup Language (HTML), 取り扱い対象: テキスト

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