Package: r-bioc-bsgenome (1.72.0-1)

[ Source: r-bioc-bsgenome  ]

infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

Questo modulo BioConductor fornisce una qualche infrastruttura di base per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings.

Other Packages Related to r-bioc-bsgenome

• dep: r-api-4.0

  virtual package provided by r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtual package provided by r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  funzioni generiche per Bioconductor

• dep: r-bioc-biocio (>= 1.14.0)

  standard input and output for Bioconductor packages

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)

  oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  utilità BioConductor per manipolare identificatori di cromosomi

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.56.1)

  rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 2.20.0)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.64.0)

  interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  implementazione di vettori e liste per BioConductor S4

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor

• dep: r-cran-matrixstats

  metodi GNU R che si applicano a righe e colonne di una matrice

• sug: r-cran-biocmanager

  accesso al repository dei pacchetti del progetto Bioconductor

• sug: r-cran-runit

  pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unità

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