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Package: python3-cctbx (2024.8+ds2+~3.21.1+ds1-3)

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strumenti Python per cristallografia

Computational Crystallography Toolbox contiene i seguenti moduli:

   - annlib_adaptbx:
   - boost_adaptbx: wrapper per funzionalità Boost in CCTBX.
   - cbflib_adaptbx:
   - ccp4io_adaptbx:
   - cctbx: librerie per applicazioni cristallografiche generali, utile
            per cristallografia per piccole molecole e macromolecolare.
   - cma_es:
   - crys3d: moduli per la visualizzazione di molecole, densità
             elettroniche e dati di spazi reciproci.
   - dxtbx: Diffraction Image Toolbox, una libreria per gestire dati di
            rilevatori a raggi X di complessità arbitraria da una varietà
            di formati standard.
   - fable: libreria per emulazione Fortran per fare il port di Fortran77
            in C++.
   - iotbx: lavorare con formati di file comuni per cristallografia.
   - libtbx: sistema di compilazione comune a tutti gli altri moduli.
             Include un wrapper molto sottile per lo strumento di
             costruzione di software SCons. Contiene anche molte utili
             infrastrutture e utilità per semplificare lo sviluppo di
             applicazioni, inclusi strumenti per test di regressione,
             parallelizzazione su sistemi multiprocessore e cluster
             gestiti, e una sintassi di configurazione modulare e
             flessibile chiamata PHIL (Python Hierarchial Interface
             Language) usata in tutto CCTBX.
   - mmtbx: funzionalità specifica per cristallografia macromolecolare.
            Include tutto ciò che è richiesto per impostare vincoli
            geometrici, correzione e scalamento bulk di solvente, analisi
            di dati di diffrazione macromolecolare, calcolo di coefficienti
            di mappa pesati e la maggior parte dei metodi implementati in
            phenix.refine. Qui c'è anche la maggior parte
            dell'infrastruttura per il server di validazione MolProbity (e
            l'equivalente Phenix).
   - omptbx: interfaccia OpenMP.
   - rstbx: toolbox per spazi reciproci per indicizzare automaticamente
            diffrazioni Bragg di piccole molecole, dati i vettori dello
            spazio reciproco.
   - scitbx: calcoli scientifici generici. Include una famiglia di tipi
             di array C++ di alto livello, una libreria per trasformate
             veloci di Fourier e un port C++ del popolare minimizzatore
             L-BFGS quasi Newtoniano.
   - smtbx: cristallografia di piccole molecole.
   - spotfinder:
   - tbxx:
   - wxtbx: controlli wxPython usati nella GUI Phenix e in varie utilità.

Questo pacchetto fornisce una raccolta selezionata di moduli Python dal progetto cctbx.

Tags: Field: Physics, Implemented in: Python, Role: role::program, science::calculation, Science: Plotting, science::visualisation, use::analysing, Purpose: Calculating, Data Visualization

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