[ Source: gmap ]
Package: gmap (2024-10-20+ds-1)
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- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Shaun Jackman (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
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- Homepage [research-pub.gene.com]
Similar packages:
allineamento tollerante agli SNP e con splicing per mRNA e letture corte
Questo pacchetto contiene i programmi GMAP e GSNAP, oltre ad utilità per gestire database di genomi in formato GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) è uno strumento per allineare sequenze di EST, mRNA e cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) è uno strumento per allineare letture di trascrittoma a terminali singoli e appaiati. Entrambi gli strumenti possono usare un database di:
* siti di splicing noti e identificare nuovi siti di splice; * polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) noti.GSNAP può allineare DNA trattato con bisolfito.
Other Packages Related to gmap
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- libreria di compressione - runtime
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| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| i386 | 5,139.7 kB | 46,583.0 kB | [list of files] |