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comandi EMBOSS extra per gestire file di classificazione di domini

I programmi DOMAINATRIX sono stati sviluppati da Jon Ison e dai suoi colleghi al MRC HGMP per la ricerca relativa ai domini delle proteine. Sono inclusi come pacchetto EMBASSY in qualità di lavoro in fase di sviluppo.

Le applicazioni nella distribuzione attuale di domainatrix sono cathparse (genera file DCF da file grezzi CATH), domainnr (rimuove domini ridondanti da un file DCF), domainreso (rimuove domini a bassa risoluzione da un file DCF), domainseqs (aggiunge voci di sequenza ad un file DCF), scopparse (genera un file DCF da file grezzi SCOP) e ssematch (cerca corrispondenze con strutture secondarie in un file DCF).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Application Suite: suite::TODO, use::analysing, Purpose: Data Conversion, Editing, use::searching, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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mips64el 0.1.660-5 60.0 kB853.0 kB [list of files]
ppc64el 0.1.660-5 61.3 kB850.0 kB [list of files]
riscv64 0.1.660-5 59.0 kB470.0 kB [list of files]