Package: gmap (2024-10-10+ds-1)

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Similar packages:

allineamento tollerante agli SNP e con splicing per mRNA e letture corte

Questo pacchetto contiene i programmi GMAP e GSNAP, oltre ad utilità per gestire database di genomi in formato GMAP/GSNAP. GMAP (Genomic Mapping and Alignment Program) è uno strumento per allineare sequenze di EST, mRNA e cDNA. GSNAP (Genomic Short-read Nucleotide Alignment Program) è uno strumento per allineare letture di trascrittoma a terminali singoli e appaiati. Entrambi gli strumenti possono usare un database di:

 * siti di splicing noti e identificare nuovi siti di splice;
 * polimorfismi a singolo nucleotide (SNP) noti.

GSNAP può allineare DNA trattato con bisolfito.

Tags: Field: Biology, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Role: Program, Purpose: Analysing

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also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: perl

"Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

libreria di compressione - runtime

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
armel	4,898.3 kB	46,229.0 kB	[list of files]