Package: samtools (1.20-3)

Links for samtools

Debian Resources:

Download Source Package samtools:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)
Étienne Mollier (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.htslib.org]

Similar packages:

elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Samtools è un insieme di utilità che manipolano allineamenti di sequenze di nucleotidi nel formato binario BAM. Importa ed esporta nei formati SAM (Sequence Alignment/Map - allineamento/mappa di sequenze) e CRAM ASCII, effettua ordinamenti, unioni e indicizzazioni e permette di rintracciare letture in qualsiasi regione in modo veloce. È stato progettato per funzionare su flussi di dati ed è in grado di aprire un file BAM o CRAM (non SAM) su un server FTP o HTTP remoto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to samtools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.20~)

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
dep: libncurses6 (>= 6)

librerie condivise per la gestione del terminale
dep: libtinfo6 (>= 6)

libreria condivisa di basso livello terminfo per la gestione del terminale
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

libreria di compressione - runtime

sug: cwltool

implementazione di riferimento di Common Workflow Language

Download samtools

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	637.6 kB	1,409.0 kB	[list of files]