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Package: python3-pyranges (0.0.111+ds-8)

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rappresentazione 2D di intervalli genomici e delle loro annotazioni

Un oggetto PyRanges deve avere le colonne Chromosome, Start ed End. Queste descrivono la posizione genomica e funzionano da etichette implicite di riga. Una colonna Strand è opzionale e aggiunge informazioni sul filamento agli intervalli. Ogni altra colonna è permessa ed è considerata metadato.

La struttura può essere riempita a partire da file .bed, .bam o .gff, e anche da rappresentazioni tabellari o testuali.

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