Package: beagle (220722-1)

[ Source: beagle  ]

identificazione del genotipo, determinazione della fase di genotipo e imputazione di marcatori non genotipizzati

Beagle fa identificazione del genotipo, determinazione della fase di genotipo, imputazione di marcatori non genotipizzati e rilevamento di segmenti di identità per discendenza. L'imputazione genotipica funziona su aplotipi a fase usando il modello di frequenza di aplotipi di Li e Stephens. Beagle implementa anche l'algoritmo Refined IBD per rilevazione di segmenti di omozigosità per discendenza (HBD) e identità per discendenza (IBD).

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::java, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Other Packages Related to beagle

• dep: default-jre

  runtime Java standard o compatibile

  or java11-runtime

  virtual package provided by default-jre, openjdk-17-jre, openjdk-21-jre

• dep: libhtsjdk-java

  Java API for high-throughput sequencing data (HTS) formats

• sug: beagle-doc

  documentazione per Beagle

Download beagle

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	352.8 kB	732.0 kB	[list of files]