Package: r-bioc-limma (3.58.1+dfsg-1) [debports]

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modelli lineari per dati di microarray

I microarray sono piastre microscopiche con filamenti corti di DNA attentamente disposti e/o superfici preparate chimicamente su cui altro DNA si lega in modo preferenziale. La quantità di DNA che si lega in diverse posizioni di questi chip, tipicamente determinata sulla base di un colorante fluorescente, deve essere interpretata. La tecnologia viene tipicamente usata con DNA derivato da RNA, cioè per determinare l'attività di un gene e/o delle sue varianti di splice. La tecnologia però è anche usata per determinare variazioni di sequenza in DNA genomico.

Questo pacchetto Bioconductor gestisce l'analisi di dati microarray di espressione genica, specialmente per l'uso di modelli lineari per l'analisi di esperimenti progettati e la valutazione dell'espressione differenziale. Il pacchetto include funzionalità di pre-elaborazione per array colorati con due colori. I metodi di espressione differenziale si applicano a tutte le piattaforme di array e trattano gli esperimenti Affymetrix, a singolo canale e a due canali in un modo unificato.

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