Package: abyss (2.3.5+dfsg-2) [debports]

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assemblatore di sequenze, parallelo, de novo per letture corte

ABySS è un assemblatore di sequenze, parallelo, de novo che è progettato per letture corte. Può essere usato per assemblare dati di sequenza di trascrittoma o genoma. La parallelizzazione è ottenuta usando MPI, OpenMP e pthread.

Other Packages Related to abyss

• dep: bsdextrautils

  utilità aggiuntive da 4.4BSD-Lite

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - libreria condivisa

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.5.9)

  libreria condivisa SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 12)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: make

  utilità per guidare la compilazione

• dep: openmpi-bin

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni -- binari

• dep: openmpi-common

  libreria per il passaggio di messaggi dalle alte prestazioni - file comuni

• dep: perl

  "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall

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