Package: mmseqs2 (11-e1a1c+ds-4) [debports]

[ Source:  ]

raggruppamento in cluster e ricerca di proteine ultra-veloce e sensibile

MMseqs2 (ricerca di sequenze Many-against-Many, molti-contro-molti) è una suite software per cercare e fare cluster di enormi insiemi di sequenze proteiche/nucleotidiche. MMseqs2 è software open source con licenza GPL implementato in C++ per Linux, MacOS e (come versione beta attraverso cygwin) Windows. Il software è progettato per essere eseguito su core e server multipli e dimostra una scalabilità molto buona. L'esecuzione di MMseqs2 può essere 10.000 volte più veloce di BLAST. A 100 volte la sua velocità ottiene quasi la stessa sensibilità. Può effettuare ricerche di profili con la stessa sensibilità di PSI-BLAST a una velocità più di 400 volte superiore.

Other Packages Related to mmseqs2

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.3)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libgomp1 (>= 6)

  libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)

• dep: libgzstream0 (>= 1.5+dfsg)

  fornisce le funzionalità della libreria C zlib in un iostream C++

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• dep: libzstd1 (>= 1.3.8)

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download mmseqs2

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	4,158.7 kB	7,066.0 kB	[list of files]