Package: snippy-examples (4.6.0+dfsg-5)

[ Source: snippy  ]

identificazione rapida di varianti aploidi e allineamento di genoma core (esempi)

Snippy trova gli SNP tra un genoma di riferimento aploide e le letture di sequenziamento NGS dell'utente. Trova sia le sostituzioni (snps) sia le inserzioni/delezioni (indels). Usa tante CPU quante gliene vengono fornite in un unico computer (testato con 64 core). È progettato pensando alla velocità e produce un insieme coerente di file di output in un'unica cartella. Può poi prendere un insieme di risultati di Snippy che usano lo stesso riferimento e generare un allineamento di SNP core (e da ultimo un albero filogenomico).

Questo pacchetto contiene dati d'esempio per testare snippy.

Other Packages Related to snippy-examples

• rec: snippy

  identificazione rapida di varianti aploidi e allineamento di genoma core

Download snippy-examples

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	303.2 kB	313.0 kB	[list of files]