Package: smrtanalysis-dev (0~20210112)

[ Source: smrtanalysis  ]

librerie di sviluppo per smrtanalysis

SMRT® Analysis è una suite di software per bioinformatica potente e open source disponibile per l'analisi di dati di sequenziamento di DNA dalla tecnologia SMRT di Pacific Biosciences. Gli utenti possono scegliere tra una varietà di protocolli di analisi che utilizzano PacBio® e strumenti di terze parti. I protocolli di analisi includono assemblaggio de novo di genoma, mappatura cDNA, rilevazione delle modifiche delle basi del DNA e analisi di ampliconi lunghi per determinare sequenze di consenso con fase.

Questo è un metapacchetto che dipende dagli strumenti di sviluppo di SMRTAnalysis.

Tags: Software Development: Libraries, Role: Development Library

Other Packages Related to smrtanalysis-dev

• dep: libpbbam-dev

  libreria per Binary Alignment/Map (BAM) di Pacific Biosciences (header)

• dep: libpbseq-dev

  libreria per analizzare dati di sequenziamento PacBio (file di sviluppo)

• dep: python3-pbcommand

  interfaccia comune a riga di comando per moduli di analisi di Pacific Biosciences

• dep: python3-pbconsensuscore

  algoritmi per consenso di sequenze multiple per PacBio -- Python 3

• dep: python3-pbcore

  libreria Python 3 per elaborare file di dati PacBio

• sug: python-kineticstools

  rilevazione di modifiche al DNA (libreria Python 2)

• sug: python-pbalign

  Package not available

• sug: python-pbgenomicconsensus

  Package not available

• sug: python-pbh5tools

  Package not available

Download smrtanalysis-dev

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	3.0 kB	9.0 kB	[list of files]
amd64	3.1 kB	9.0 kB	[list of files]
arm64	3.0 kB	9.0 kB	[list of files]
mips64el	3.0 kB	9.0 kB	[list of files]
ppc64el	3.0 kB	9.0 kB	[list of files]
riscv64	3.0 kB	9.0 kB	[list of files]