Package: seqmagick (0.8.6-3)

[ Source: seqmagick  ]

interfaccia simile a imagemagick per Biopython SeqIO

Seqmagick è una piccola utilità per esporre la conversione di formato di file in BioPython in un modo comodo.

Le funzionalità includono:

 * Modifica di sequenze:
   - rimozione di gap;
   - invertita e complementare invertita;
   - taglio dei residui ad un intervallo;
   - modifica di maiuscole/minuscole;
   - ordinamento per lunghezza o ID.
 * Visualizzazione di informazioni sui file di sequenza.
 * Sottoinsieme dei file di sequenza in base a:
   - posizione;
   - ID;
   - deduplicazione.
 * Filtraggio delle sequenze in base al punteggio di qualità.
 * Taglio degli allineamenti ad una regione di interesse definita dai
   primer forward e reverse.

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