Package: r-bioc-pwalign (1.2.0-2)

[ Source: r-bioc-pwalign  ]

effettua allineamenti di sequenze a coppie

Le due funzioni principali nel pacchetto sono pairwiseAlignment() e stringDist(). La prima risolve problemi di allineamento globale (Needleman- Wunsch), allineamento locale (Smith-Waterman) e allineamento di sovrapposizione (terminali liberi). La seconda calcola la distanza di edit di Levenshtein o la matrice del punteggio di allineamento a coppie per un insieme di stringhe.

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