Package: norsnet (1.0.17-7)

[ Source: norsnet  ]

strumento per identificare ripiegamenti non strutturati nelle proteine

NORSnet può distinguere tra segmenti contigui molto lunghi con una struttura secondaria non regolare (regioni NORS, NOn-regular Secondary Structure) e proteine ben ripiegate.

NORSnet è stato addestrato su informazioni predette piuttosto che su dati sperimentali. Ciò permette a NORSnet di arrivare in regioni nello spazio della sequenza che non sono coperte dagli strumenti specializzati per predire il disordine. Uno svantaggio di questo approccio è che non è ottimale per l'identificazione della regione con disordine "medio".

NORSnet accette i seguenti input, ulteriormente descritti in norsnet(1): * la sequenza di una proteina in un file FASTA; * predizione di prof(1) della struttura secondaria e dell'accessibilità

  al solvente;

* un file HSSP; * predizione di profbval(1) dei residui flessibili/rigidi.

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