Package: clustalw (2.1+lgpl-7 and others)

[ Source: clustalw  ]

allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

Questo programma effettua un allineamento di sequenze multiple di nucleotidi o di amminoacidi. Riconosce il formato di input delle sequenze e se le sequenze sono acidi nucleici (DNA/RNA) o amminoacidi (proteine). Il formato di output può essere selezionato tra diversi formati per allineamenti multipli come Phylip o FASTA. Clustal W è molto ben accettato.

L'output di Clustal W può essere modificato manualmente, ma è preferibile farlo con un editor di allineamenti come SeaView o all'interno del suo compagno Clustal X. Quando si costruisce un modello da un allineamento, questo può essere applicato per ricerche migliorate in database. Il pacchetto Debian hmmer crea modelli simili nella forma di un HMM.

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, User Interface: Text-based Interactive, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Comparing, Supports Format: works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Other Packages Related to clustalw

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: clustalx

  allineamento multiplo di sequenze di acidi nucleici e di proteine (interfaccia grafica)

• sug: seaview

  interfaccia multipiattaforma per l'allineamento di sequenze e filogenia

• enh: bioperl-run

  wrapper BioPerl: script

• enh: emboss

  suite software open source europea per la biologia molecolare

• enh: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
riscv64	2.1+lgpl-7+b1	274.2 kB	622.0 kB	[list of files]