[ Source: qcat ]
Package: qcat (1.1.0-6)
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Similar packages:
demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ
Qcat è uno strumento a riga di comando per fare il demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ. Accetta file FASTQ con basi identificate e divide le letture in file FASTQ separati secondo il loro codice a barre. Qcat rende gli algoritmi di demultiplexing usati in albacore/guppy e EPI2ME disponibili per essere usati localmente con file FASTQ. Attualmente qcat implementa l'algoritmo EPI2ME.
Other Packages Related to qcat
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
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- dep: python3-biopython
- libreria Python 3 per bioinformatica
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- dep: python3-parasail
- Python3 bindings for the parasail C library
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- dep: python3-six
- libreria di compatibilità per Python 2 e 3
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- dep: python3-yaml
- analizzatore ed emettitore YAML per Python 3
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- sug: qcat-examples
- demultiplexing di letture Oxford Nanopore da file FASTQ (esempi)
Download qcat
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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all | 30.5 kB | 269.0 kB | [list of files] |