Package: proalign (0.603-6 and others)
Links for proalign
Debian Resources:
Download Source Package proalign:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Andreas Tille (QA Page)
- Thorsten Alteholz (QA Page)
External Resources:
- Homepage [loytynojalab.biocenter.helsinki.fi]
Similar packages:
programma per allineamenti multipli probabilistici
ProAlign effettua allineamenti multipli probabilistici usando modelli di Markov nascosti (HMM). Include un'interfaccia grafica (GUI) che permette di: (i) effettuare allineamenti di sequenze di nucleotidi o di aminoacidi, (ii) visualizzare la qualità delle soluzioni, (iii) filtrare le regioni con allineamenti non affidabili e (iv) esportare gli allineamenti per altro software.
ProAlign usa un metodo progressivo, in modo che l'allineamento multiplo viene creato passo a passo, effettuando allineamenti a coppie nei nodi di un albero guida. Le sequenze sono descritte con vettori di probabilità dei caratteri, e ogni allineamento a coppie ricostruisce la sequenza ancestrale (genitrice) calcolando le probabilità di diversi caratteri sulla base di un modello evolutivo.
Other Packages Related to proalign
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- dep: default-jre
- runtime Java standard o compatibile
Download proalign
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| armel | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| armhf | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 0.603-3 | 144.2 kB | 164.0 kB | [list of files] |
| i386 | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| ia64 (unofficial port) | 0.603-5 | 162.3 kB | 182.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 0.603-6 | 164.1 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| s390x | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 0.603-6 | 164.7 kB | 184.0 kB | [list of files] |