Package: plink2 (2.00~a5.8-231123+dfsg-1 and others)

[ Source: plink2  ]

insieme di strumenti di analisi per associazione dell'intero genoma

plink si aspetta in input i dati da chip SNP (polimorfismi a singolo nucleotide) di molti individui e la loro descrizione fenotipica di una malattia. Trova associazioni tra una variazione singola o una coppia di variazioni nel DNA con un fenotipo e può recuperare le annotazioni SNP da una fonte in linea.

Gli SNP possono essere analizzati individualmente o a coppie per valutare la loro associazione con fenotipi di malattie. È possibile ricercare congiuntamente variazioni nel numero di copie. Sono stati implementati svariati test statistici.

plink2 è un aggiornamento esaustivo di plink e plink1.9 con nuovi algoritmi e nuovi metodi, più veloce e con meno consumo di memoria rispetto al primo plink.

Other Packages Related to plink2

• dep: libblas3

  implementazione di riferimento dell'algebra lineare di base, libreria condivisa

  or libblas.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE

• dep: liblapack3

  libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa

  or liblapack.so.3

  virtual package provided by libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libzstd1 (>= 1.5.5)

  veloce algoritmo di compressione senza perdita

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ppc64el	2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1	1,150.3 kB	3,220.0 kB	[list of files]