Package: ipig (0.0.r5-4)

[ Source: ipig  ]

integrazione di PSM con la visualizzazione con browser genomici

iPiG ha come obiettivo l'integrazione di PSM (Peptide Spectrum Match, corrispondenza di spettro di peptide) da identificazione di peptidi con spettrometria di massa (MS) in visualizzazioni genomiche fornite da navigatori di genomi come il navigatore di genomi UCSC (http://genome.ucsc.edu/).

iPiG prende PSM nel formato standard per MS mzIdentML (*.mzid) o in formato testuale e fornisce i risultati nei formati per tracce genomici (file BED e GFF3) che possono essere facilmente importati in navigatori di genomi.

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