test di ipotesi multiple basati su ricampionamenti per Bioconductor
Procedure per test multipli bootstrap non parametrici e con permutazione,
basati su ricampionamenti, (inclusi metodi empirici bayesiani) per
controllare il tasso di errore familiare (FWER), tasso di errore familiare
generalizzato (gFWER), probabilità di coda della proporzione di falsi
positivi (TPPFP) e tasso di false scoperte (FDR). Sono implementate
diverse scelte di distribuzioni nulle basate su bootstrap (centrata,
centrata e scalata, trasformata per quantile). Sono disponibili metodi a
singolo passaggio e passo-passo. Sono inclusi test basati su una varietà
di statistiche t ed F (incluse statistiche t basate su parametri di
regressione da modelli lineari e di sopravvivenza, oltre a quelle basate
su parametri di correlazione). Quando sondano ipotesi con statistiche t,
gli utenti possono anche selezionare una distribuzione nulla,
potenzialmente più veloce, che è una normale multivariata con media zero e
matrice di varianza e covarianza derivata da funzione di influenza
vettoriale. I risultati sono riportati in termini di p-value corretti,
regioni di confidenza e punti di cutoff dei test statistici. Le procedure
sono applicabili direttamente per identificare geni con espressione
differenziale in esperimenti con microarray di DNA.
