strumento per assemblare letture corte Illumina in piccole regioni
Fml-asm è uno strumento a riga di comando per assemblare letture corte
Illumina in regioni con dimensioni da 100 pb a 10 milioni pb, sulla base
della libreria fermi-lite. È in gran parte una versione leggera in memoria
di fermikit senza la generazione di alcun file intermedio. Eredita le
prestazioni, l'impronta di memoria relativamente piccola e le funzionalità
di fermikit. In particolare, fermi-lite è capace di mantenere eventi di
eterozigosi e perciò può essere usato per assemblare regioni diploidi con
lo scopo dell'identificazione di varianti.
