Package: bwa (0.7.17-7 and others) [debports]
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- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Similar packages:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.
Other Packages Related to bwa
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
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- rec: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- sug: samtools
- elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM
Download bwa
Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
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ppc64 (unofficial port) | 0.7.17-7+b4 | 216.9 kB | 576.0 kB | [list of files] |