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Package: postgresql-17-rdkit (202309.3-7 and others)

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raccolta di software per chemioinformatica e apprendimento automatico (PostgreSQL Cartridge)

RDKit è un ambiente software per chemioinformatica e apprendimento automatico basato su Python/C++. Le funzionalità includono:

 * gestione e trasformazione di reazioni chimiche,
 * ricerca di sottostrutture con SMARTS,
 * SMILES canonico,
 * allineamento molecola-molecola,
 * un vasto numero di descrittori molecolari, inclusi topologici, di
   composizione, EState, SlogP/SMR, VSA e vettori Feature-map,
 * frammentazione usando le regole RECAP,
 * generazione e descrizione di coordinate 2D, inclusa descrizione con
   vincoli,
 * generazione di coordinate 3D usando l'incorporazione di geometria,
 * campi di forza UFF e MMFF94,
 * gestione della chiralità, incluso calcolo di codici (R/S) stereochimici,
 * ricerca di farmacofori 2D,
 * impronte digitali, inclusi stile Daylight, di coppie di atomi, torsioni
   topologiche, algoritmo di Morgan e chiavi MACCS,
 * calcolo di similarità di forma,
 * massima sottostruttura comune multimolecola,
 * apprendimento automatico con algoritmi di teoria dell'informazione e
   clustering,
 * calcolo della carica parziale di Gasteiger-Marsili.

I formati di file gestiti da RDKit includono MDL Mol, PDB, SDF, TDT, SMILES e il formato binario di RDKit.

Questo pacchetto contiene l'estensione PostgreSQL.

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