[ trixie ]
[ sid ]
[ experimental ]
[ Source: r-bioc-pwalign ]
Package: r-bioc-pwalign (1.0.0-2)
Links for r-bioc-pwalign
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-pwalign:
- [r-bioc-pwalign_1.0.0-2.dsc]
- [r-bioc-pwalign_1.0.0.orig.tar.gz]
- [r-bioc-pwalign_1.0.0-2.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
effettua allineamenti di sequenze a coppie
Le due funzioni principali nel pacchetto sono pairwiseAlignment() e stringDist(). La prima risolve problemi di allineamento globale (Needleman- Wunsch), allineamento locale (Smith-Waterman) e allineamento di sovrapposizione (terminali liberi). La seconda calcola la distanza di edit di Levenshtein o la matrice del punteggio di allineamento a coppie per un insieme di stringhe.
Other Packages Related to r-bioc-pwalign
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- dep: libc6 (>= 2.4)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
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- dep: r-api-bioc-3.19
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
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- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)
- funzioni generiche per Bioconductor
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- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.72.1)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
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- dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)
- contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
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- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
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- dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)
- rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor
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- sug: r-cran-runit
- pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unitÃ
Download r-bioc-pwalign
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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mips64el | 734.3 kB | 1,151.0 kB | [list of files] |