Package: r-bioc-genomicranges (1.54.1+dfsg-1) [debports]

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rappresentazione e manipolazione di intervalli genomici di BioConductor

La capacità di archiviare in modo efficiente le annotazioni e gli allineamenti genomici ha un ruolo centrale nell'analisi di dati di sequenziamento ad alte prestazioni (alias dati NGS). Il pacchetto definisce contenitori generici per archiviare intervalli genomici oltre a contenitori più specializzati per archiviare allineamenti rispetto ad un genoma di riferimento.

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• sug: r-bioc-genomicfeatures

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• sug: r-bioc-rsamtools (>= 1.13.53)

  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• sug: r-bioc-rtracklayer

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• sug: r-bioc-summarizedexperiment (>= 0.1.5)

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• sug: r-cran-digest

  pacchetto GNU R per "hash digest" di strutture dati di R

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  pacchetto GNU R di classi per matrici dense e sparse

• sug: r-cran-rmarkdown

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	1,783.4 kB	2,812.0 kB	[list of files]