Package: macs (2.2.6-3 and others) [debports]

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analisi basata su modelli di ChIP-Seq su sequenziatori di letture corte

MACS modella in modo empirico la lunghezza dei frammenti ChIP sequenziati, che tende ad essere più corta delle stime di dimensione per sonicazione o costruzione di biblioteche genomiche, e la usa per migliorare la risoluzione spaziale dei siti di legame predetti. MACS usa anche una distribuzione di Poisson dinamica per catturare in modo efficace i bias locali nella sequenza del genoma, permettendo una predizione più sensibile e robusta. MACS si comporta bene al confronto degli algoritmi esistenti ChIP-Seq di ricerca di picchi, è disponibile pubblicamente come open source e può essere usato per ChIP-Seq con o senza campioni di controllo.

Other Packages Related to macs

• dep: libc6.1 (>= 2.30)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6.1-udeb

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.9)

  dep: python3 (>= 3.8~)

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	2.2.6-3+b1	2,653.4 kB	11,172.0 kB	[list of files]