Package: libhts-dev (1.19+ds-1.1 and others) [debports]

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file di sviluppo per HTSlib

HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.

HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.

Questo pacchetto contiene i file di sviluppo per HTSlib: header, libreria statica, pagine di manuale, ecc.

Per compatibilità con sambamba, è stata esportata la routine interna cram_to_bam, adottando qui una patch che si trova in guix.

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Download libhts-dev

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
ia64 (unofficial port)	1.19+ds-1.1+b1	2,024.1 kB	8,348.0 kB	[list of files]