Package: boxshade (3.3.1-14) [debports]
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- Homepage [www.ch.embnet.org]
Similar packages:
belle stampe di allineamenti multisequenza
Boxshade è un programma per creare stampe di bell'aspetto a partire da sequenze proteiche o di DNA multi-allineate. Il programma non fa il reale allineamento e necessita di un file input creato da un programma per allineamenti multipli o creato a mano con strumenti adatti.
Boxshade legge sequenze multiallineate da file PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save, (limitatamente ad un massimo di 150 sequenze con fino a 10.000 elementi ciascuna). Vari tipi di ombreggiatura possono essere applicati a residui identici/simili. L'output è scritto a schermo o in un file nei seguenti formati: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.
Other Packages Related to boxshade
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- dep: libc6.1 (>= 2.31)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
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- sug: kalign
- allineamenti multipli di sequenza globali e progressivi
- or clustalw
- allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi
- or mafft
- programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche
- or hmmer
- profilamento di modelli di Markov nascosti per analisi di sequenze proteiche
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- sug: seaview
- interfaccia multipiattaforma per l'allineamento di sequenze e filogenia
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages
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- sug: xfig
- strumento per generazione interattiva di figure in X11
Download boxshade
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
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ia64 (unofficial port) | 68.1 kB | 277.0 kB | [list of files] |