meta-analisi di associazioni a livello di intero genoma
Il software GWAMA (Genome-Wide Association Meta Analysis) esegue
meta-analisi dei risultati di studi GWA su fenotipi binari o quantitativi.
Meta-analisi di effetti fissi e casuali sono effettuate per SNP, sia
genotipizzati direttamente sia imputati, usando stime della probabilità
allelica e un intervallo di confidenza del 95% per tratti binari, e stime
della dimensione dell'effetto allelico ed errore standard per fenotipi
quantitativi. GWAMA può essere usato per analizzare i risultati di tutti i
differenti modelli genetici (moltiplicativo, additivo, dominante,
recessivo). Il software incorpora funzionalità di intercettazione degli
errori per identificare errori di allineamento dei filamenti e flipping
degli alleli ed esegue test di eterogeneità degli effetti tra gli studi.
