Package: libhts3t64 (1.20+ds-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni

HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.

HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.

Other Packages Related to libhts3t64

• dep: libbz2-1.0

  libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.18.0)

  libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  libreria per compressione in formato XZ

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0)

  toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

Download libhts3t64

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	1.20+ds-1+b1	453.8 kB	1,181.0 kB	[list of files]